醫院堅持“大專科，小綜合”的辦院理念，開設有感染性疾病科、結核病科、肝病科、艾滋病科、腫瘤科、消化內科、中醫科、中西醫結核科、胸外科、骨外科、普外科、腦外科、創傷外科、急診科、重癥醫學科、麻醉科、超聲介入科、口腔科、眼科、婦產科等臨床科室；設有檢驗科、醫學影像科、病理科、呼吸病介入診療科、功能科、藥劑科等醫技科室；設有武漢市傳染病研究所和武漢市肝病研究所；設有武昌分院、江北門診部，已形成了優勢突出、特色鮮明的學科建設體系。
全院擁有衛生專業技術人員685人，其中博士研究生10人，碩研究生50人，副高以上專業技術人員109人。擁有碩士研究生導師3名，武漢市有突出貢獻中青年專家1人，武漢市黃鶴英才（醫學計劃）1人，武漢市中青年醫學骨干人才9人。在各級專業學會擔任主任委員1人，副主任委員以上職務3人，委員以上職務人員50余人。
醫院建有層流手術室及武漢地區首個負壓病房，建有P2+實驗室。配有核磁共振、64排CT、數字化X光機、膜肺氧合系統、數字減影血管造影系統、胸腔鏡、縱膈鏡、超聲內鏡、彩色超聲波診斷儀、肺功能儀、人工肝血液凈化系統、全自動生化分析儀、流式細胞儀、基因分析儀、PCR擴增儀、熒光定量PCR儀等先進的醫療設備。
醫院設有DSA及咯血診療中心，以多學科、多專業協作，促進對于咯血的診治，目前已成功診治多例致命性大咯血、咯血窒息昏迷等病人。
我院是國際體外生命支持組織（elso）的成員，在華中地區率先開展的體外膜肺氧合技術（ECMO）治療急性呼吸窘迫綜合征。2016年運用ECMO成功救治了4例重癥肺炎并嚴重呼吸衰竭患者，包括一例湖北省首例危重H7N9禽流感患者。
我院重癥醫學科（ICU）采用ECMO及血漿置換、CRRT等技術救治各類危重癥（艾滋病并發重癥肺炎、肺結核并發ARDS、膿毒癥并發ARDS、麻疹并發重癥肺炎、結核性腦膜炎等）所致呼吸衰竭的病人取得非常好的療效。
醫院擁有國家級臨床重點建設專科1個，中部醫療服務中心省級重點專科2個，武漢市臨床重點專科5個，承擔國家、省、市各級科研項目50余項，參加國家“十一五”“十二五”重大專項子課題研究7項，參加國家中醫藥管理局中醫藥防治傳染病行業專項研究4項。榮獲湖北省人民政府科技進步二等獎2項，三等獎1項，武漢市人民政府科技進步一等獎1項、三等獎1項，獲中國中西醫結合學會科技進步三等獎1項。
2016年醫院榮獲武漢市五一勞動獎狀，先后榮獲湖北省醫務管理工作先進集體、湖北省衛生應急工作先進集體、武漢市衛生計生委先進基層黨組織、武漢市衛生財務工作先進單位、武漢市醫院感染管理先進集體等，傳染病診療及管理水平位列中部地區首位。
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